Свидетельство о регистрации некоммерческой организации было выдано Министерством юстиции Российской Федерации.
«В 2013 году, в очередной межкризисный период, мы задумались о будущем и создали специализированный фонд целевого капитала «Истоки», — рассказывает Председатель Попечительского совета Фонда «Истоки» Владимир Якунин. — Созданный эндаумент помог нам без существенных потерь пройти непростые 2014 и 2015 годы и сохранить ключевые программы: «Святость материнства», конкурс социальной журналистики, медицинские экспедиции «Рубежи России» и многие другие»
Фонд «Истоки» — один из первых российских эндаумент-фондов, созданных для поддержки общественных и благотворительных программ. Основной получатель средств из дохода от доверительного управления целевым капиталом Фонда «Истоки» является Фонда Андрея Первозванного.
Также Фонд «Истоки» поддерживает ряд других проектов, например, Акселератор цифровых коммуникаций НКО «Стань заметным».
Целевой капитал позволяет обеспечивать стабильное финансирование программ и проектов, независимо от интенсивности текущих пожертвований. Благотворители имеют возможность планировать свои действия на годы и даже десятилетия вперед — тем самым достигается максимальный, накопительный социальный эффект в решении тех или иных общественно значимых задач.